有学者认为肠胃炎之后，肠子的黏膜会诱发敏感化，也有学者提出代谢乳糖的酵素会被破坏，所以会变成短暂性的乳糖不耐症，也有学者认为是小肠的黏膜受伤了，其实原因目前还不是很确定，所以肠胃炎之后，很多小朋友变成慢性腹泻，有些人会腹泻超过一个月以上，所以有些宝宝会吃很长时间的止泻药，医师有时会建议换成无乳糖奶粉一段时间，或是摄取一些益生菌，因为益生菌可以缩短肠胃炎引起慢性腹泻的时间。
所以如果宝宝本来吃一般奶粉没有问题，一次肠胃炎之后，只能吃无乳糖奶粉才不会拉肚子，这种只能说应该是肠胃炎之后引起短暂的乳糖不耐症，时间到了，还是可以换成平常喝的一般奶粉。
至于大便的颜色，有些宝宝的颜色会出现绿大便或是偏橘的大便，其实都是奶粉成分代谢后的颜色，例如铁的成分较高或是吸收不好，可能就会出现绿大便，母奶则跟妈妈的食物有关，所以吃母奶的宝宝，大便的颜色也会有不同颜色变化，爸妈只要注意有没有出现血便或是黏液状的大便，或是大便颜色是不是像黏土状的白色，可能代表某些疾病，偏绿偏橘的大便都是可以接受的。
儿童慢性腹泻的原因很多，如果只是感染后造成的，可以跟医师讨论看看换奶或是食物的摄取有没有限制，服用些益生菌也会有一点帮助。
